При контакте с белками бактериальной стенки или ферментными белками образует йодамины, и блокируя их действие оказывает бактерицидное действие на микроорганизмы. Благодаря большому размеру комплексной молекулы, Бетадин плохо проникает через биологические барьеры, поэтому практически не проявляется системное действие йода. Проникновение в ткани на глубину около 1мм, не препятствует нормальным процессам регенерации. За счет постепенного высвобождения йода препараты Бетадина действуют длительно.